Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MKLN1Q9UL63 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms