Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms