Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4Q9UBX2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms