Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHPF2Q9P2E5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms