Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCMF1Q9P0J7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms