Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDE1Q9NZC3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDE1Q9NZC3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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