Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GIN1Q9NXP7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms