Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM248Q9NWD8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM248Q9NWD8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms