Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PNPLA3Q9NST1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms