Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
USP29Q9HBJ7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
USP29Q9HBJ7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms