Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NRDE2Q9H7Z3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms