Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CACNG6Q9BXT2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms