Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEMA3CQ99985 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SEMA3CQ99985 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms