Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LGMNQ99538 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LGMNQ99538 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms