Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNFRSF13CQ96RJ3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TNFRSF13CQ96RJ3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms