Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms