Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFXN2Q96NB2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms