Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC114Q96M63 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms