Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NMD3Q96D46 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms