Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMIGD2Q96BF3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms