Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF34Q969K3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms