Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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