Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms