Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf47Q8NEP4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms