Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM71DQ8N9W8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms