Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC29A4Q7RTT9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms