Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GDPD3Q7L5L3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms