Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18B1Q6NT16 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms