Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RTL6Q6ICC9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTL6Q6ICC9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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