Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q5VSD8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Q5VSD8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms