Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB6CQ53S08 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms