Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL38Q2WGJ6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms