Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMU1Q2TAY7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms