Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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