Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RBBP7Q16576 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RBBP7Q16576 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms