Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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