Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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