Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CUL4AQ13619 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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