Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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FOXE3Q13461 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FOXE3Q13461 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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