Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC109466.1-206ENST00000522686 774 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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MKRN4PQ13434 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
MKRN4PQ13434 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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