Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PMS2P3Q13401 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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PMS2P3Q13401 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMS2P3Q13401 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PMS2P3Q13401 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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