Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP140Q13342 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP140Q13342 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP140Q13342 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms