Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SELENBP1Q13228 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms