Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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