Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms