Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms