Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms