Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
TNP2Q05952 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TNP2Q05952 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms