Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms