Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ANKRD66-202ENST00000565422 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms